El Hospital tiene una larga tradición en investigación que le sitúa como institución de referencia tanto a nivel nacional como internacional.
Una parte significativa de las actividades de investigación del Hospital se articulan a través del Institut d’Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS).
La gestión y administración de los proyectos de investigación se realizan a través de la Fundació Clínic per a la Recerca Biomèdica.